با توجه به کثرت پایان‌نامه‌های ارسالی به دبیرخانه‌ی جایزه‌ی دکتر فتح‌الله مجتبایی و از آن‌جا که شیوع بیماری کووید ۱۹، برگزاری جلسات داوری منظم را با اختلال مواجه کرده است، مراسم اهدای جایزه به برترین پایان‌نامه‌ی دکتری ادبیات فارسی و ادیان و عرفان  سال ۹۸، با تاخیر در بهار ۱۴۰۰ برگزار خواهد شد.

بدیهی است در این زمان فقط پایان‌نامه‌هایی مورد ارزیابی قرار می‌گیرند که تا پایان مهر ۹۹ به دبیرخانه ارسال شده باشند.